Głównym bohaterem tej gry jest zmutowany jamraj zwany Crash Bandicoot. Musi on uratować swoją dziewczynę, Tawne. Porwał ją doktor Neo Cortex, szalony naukowiec, wyśmiewany przez społeczeństwo za swoje dziwaczne teorie. Chce on stworzyć zmutowaną armię potworów, którą posłuży się do zniszczenia świata. Crash musi ocalić swoja miłość a pomaga mu w tym duch szamana zwany Aku Aku.